本みりんには約12.5〜14.5％のアルコールが含まれており、アルコールの保存能力により常温で保存しても傷みにくいです。
ただし、キャップがしっかりと締まっていないとアルコール分が徐々に低下しますので、保管の際はご留意ください。
また、高温で保存したり紫外線に当たりますと、本みりんの風味に影響を与えますので、できるだけ直射日光のあたらない冷暗所（冷蔵庫である必要はない）で保存してください。
冷蔵庫で保管される際は、冷えすぎると本みりんに含まれる糖が白く結晶化することがあります。品質に影響はなく、温めれば元に戻りますのでご安心ください。