アルコールは加熱することで徐々に蒸発しますので、十分加熱する料理ですとアルコールは飛んで残りません。
ただし、和え物など、熱を加えずそのまま使う料理などでは、あらかじめ、本みりんを加熱して煮切っていただくことをおすすめします。